Заявление вычета НДС по счету-фактуре на предоплату осуществляется в том периоде, в котором получен счет-фактура.

По разъяснениям Минфина, в случае, когда Покупатель перечислил аванс в одном налоговом периоде, а счет-фактуру от продавца получил в следующем, вычет с такой предоплаты покупатель вправе применить в том квартале, в котором получил счет-фактуру. Не имеет значения, что продавец выставил документ в предыдущем налоговом периоде.

Письмо Минфина России от 16.04.2019 N 03-07-09/27004